Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpsf1Q9EPU4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf1Q9EPU4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf1Q9EPU4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms