Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn1Q9EPL2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms