Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r53Q9EP93 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms