Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trmt112Q9DCG9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trmt112Q9DCG9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms