Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmg20aQ9DC33 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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