Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Foxp4Q9DBY0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxp4Q9DBY0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms