Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrpraQ9DBG7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms