Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38bQ9DAV9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38bQ9DAV9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms