Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc89Q9DA73 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms