Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DA42 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DA42 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DA42 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DA42 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DA42 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DA42 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms