Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sgf29Q9DA08 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgf29Q9DA08 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms