Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1700025F22RikQ9D9Y7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms