Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc103Q9D9P2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms