Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp12Q9D9M2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp12Q9D9M2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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