Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntd1Q9D995 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntd1Q9D995 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms