Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp5Q9D7S9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms