Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
2310002L09RikQ9D7L5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
2310002L09RikQ9D7L5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
2310002L09RikQ9D7L5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
2310002L09RikQ9D7L5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
2310002L09RikQ9D7L5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms