Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capns2Q9D7J7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms