Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl40Q9D783 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms