Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc8Q9D753 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc8Q9D753 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms