Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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