Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms