Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc94Q9D6J3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms