Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms