Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms