Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Speer4f1Q9D5Q6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms