Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms