Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam227bQ9D518 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam227bQ9D518 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms