Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox2aQ9D4Y3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox2aQ9D4Y3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms