Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4X6

Samt4, Spermatogenesis-associated multipass transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt4Q9D4X6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samt4Q9D4X6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt4Q9D4X6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt4Q9D4X6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samt4Q9D4X6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms