Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms