Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmntd1Q9D4C1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmntd1Q9D4C1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmntd1Q9D4C1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmntd1Q9D4C1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms