Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Obox1Q9D350 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Obox1Q9D350 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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