Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt20Q9D312 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms