Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z1

Ceacam20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam20Q9D2Z1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ceacam20Q9D2Z1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms