Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Snapc3Q9D2C9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snapc3Q9D2C9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snapc3Q9D2C9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snapc3Q9D2C9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snapc3Q9D2C9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snapc3Q9D2C9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snapc3Q9D2C9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snapc3Q9D2C9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snapc3Q9D2C9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Snapc3Q9D2C9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Snapc3Q9D2C9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Snapc3Q9D2C9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snapc3Q9D2C9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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