Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms