Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Batf3Q9D275 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms