Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cysrt1Q9D1E4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms