Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Hddc3Q9D114 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Hddc3Q9D114 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc3Q9D114 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Hddc3Q9D114 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms