Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem53Q9D0Z3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms