Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T7

Gkn3, Gastrokine-3, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn3Q9D0T7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gkn3Q9D0T7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gkn3Q9D0T7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gkn3Q9D0T7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gkn3Q9D0T7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gkn3Q9D0T7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gkn3Q9D0T7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gkn3Q9D0T7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gkn3Q9D0T7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn3Q9D0T7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms