Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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Zbed3Q9D0L1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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