Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CenpnQ9CZW2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpnQ9CZW2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpnQ9CZW2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CenpnQ9CZW2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms