Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3bQ9CZT8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms