Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Polr3eQ9CZT4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3eQ9CZT4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms