Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp11Q9CZJ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp11Q9CZJ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms