Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms