Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms