Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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